Expliqué: Types de coronavirus humains et les symptômes qu'ils provoquent
Bien qu'il existe des centaines de coronavirus, nous savons qu'il y en a sept qui peuvent infecter les humains.

Bien qu'il existe des centaines de coronavirus qui provoquent des maladies chez les animaux tels que les porcs, les chameaux, les chauves-souris et les chats, à ce jour, sept types différents de coronavirus ont été identifiés qui infectent les humains. Quels sont-ils et quels types de symptômes provoquent-ils?
Que sont les coronavirus ?
Les coronavirus sont une grande famille de virus à ARN simple brin qui provoquent des maladies chez les animaux et les humains. Chez l'homme, les virus provoquent généralement des maladies des voies respiratoires supérieures légères à modérées telles que le rhume. Au cours des deux dernières décennies, des coronavirus plus agressifs sont apparus, capables de provoquer des maladies graves et même la mort chez l'homme. Ceux-ci incluent le SARS-CoV, le MERS et maintenant le SARS-CoV-2.
Les coronavirus humains ont été caractérisés pour la première fois au milieu des années 1960 et ils sont principalement considérés comme responsables des infections des voies respiratoires supérieures chez les enfants. En 1965, les scientifiques DJ Tyrrell et ML Bynoe ont été les premiers à identifier un coronavirus humain, qu'ils ont isolé du lavage nasal d'un enfant de sexe masculin qui présentait des symptômes de rhume. Ils ont appelé la souche B814 et plus tard en 1968, le terme coronavirus a été accepté. Ces virus sont nommés ainsi en raison des pointes trouvées à leur surface qui leur donnent l'apparence d'une couronne lorsqu'elles sont observées au microscope électronique.

Chez les animaux, les coronavirus peuvent provoquer des diarrhées chez les vaches et les porcs et des maladies des voies respiratoires supérieures chez les poulets. Le premier coronavirus a été isolé en 1937 et c'est le virus de la bronchite infectieuse (IBV) qui a provoqué des maladies respiratoires chez les poulets.
Classer les coronavirus
De manière générale, les coronavirus (CoV) constituent le plus grand groupe de virus appartenant à l'ordre des Nidovirales, qui comprend les Coronaviridae parmi trois autres. Les Coronavirinae sont l'une des deux sous-familles de Coronaviridea, l'autre étant Torovirinae. Les coronavirus peuvent être subdivisés en coronavirus alpha, bêta, gamma et delta.
Le groupe d'étude sur les coronavirus du Comité international de taxonomie des virus est chargé de les classer et il y a environ sept ans, ils les ont classés dans les divisions susmentionnées au lieu des groupes sérologiques de trois. Selon un article publié dans le Journal of Virology, alors que les coronavirus des quatre catégories peuvent être trouvés chez les mammifères, les coronavirus de chauve-souris sont la source génétique probable des coronavirus alpha et bêta, tandis que les coronavirus aviaires sont les sources génétiques probables des coronavirus gamma et delta.
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Bien qu'il existe des centaines de coronavirus, nous savons qu'il y en a sept qui peuvent infecter les humains. Sur les sept, deux sont des coronavirus alpha (229E et NL63) et quatre sont des coronavirus bêta (OC43, HKU1, MERS et SARS-CoV). La classification des virus est basée sur leur phylogénie, c'est-à-dire qu'elle reflète comment ces souches virales ont évolué à partir de leurs ancêtres communs.
Essentiellement, cela signifie qu'à chaque nouvelle émergence d'un virus, sa classification dépend de sa relation avec d'autres virus connus et s'il est suffisamment distinct pour être appelé une nouvelle espèce ou s'il appartient à une espèce existante. Par exemple, le SARS-CoV et le SARS-CoV-2 sont génétiquement liés.
Alternativement, les coronavirus peuvent être classés en fonction de la sérologie (surveillance de la réponse des anticorps du système immunitaire à l'exposition virale) selon laquelle ils peuvent être divisés en trois groupes de I à III. Les groupes I et II font référence aux coronavirus de mammifères et le groupe III comprend les coronavirus aviaires. Le 229E est inclus dans le groupe I, qui comprend en grande partie des agents pathogènes animaux. Le groupe II se compose en grande partie d'agents pathogènes d'importance vétérinaire et comprend OC43, HKU1 et NL63. Les coronavirus du SRAS sont également classés dans le groupe II.
Partout dans le monde, les gens sont couramment infectés par 229E, HKU1, NL63 et OC43. Parfois, les coronavirus qui infectent les animaux peuvent évoluer et devenir un coronavirus humain, notamment le MERS, le SARS-CoV-1 et le SARS-CoV-2.
Quand les coronavirus humains ont été identifiés pour la première fois
229E : L'une des premières souches de coronavirus à être décrite au milieu des années 60, peut-être par D Hamre et JJ Procknow dans leur article de 1966 intitulé Un nouveau virus isolé des voies respiratoires humaines, publié dans Experimental Biology and Medicine.
OC43 : Découvert en 1967 selon le Journal of Virology. Cependant, un article du Virology Journal l'a décrit comme le premier coronavirus humain à être découvert en 1965, citant un article de 1966 écrit par Tyrrell et Bynoe qui ont travaillé avec l'écouvillon nasal intitulé B814.
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NL63 et HKU1 : Identifié pour la première fois aux Pays-Bas en 2004, probablement après avoir été isolé chez un nourrisson de sept mois présentant des symptômes respiratoires. Pendant ce temps, il y a eu une augmentation de la recherche sur les coronavirus humains, ce qui a conduit à la découverte de NL63 et HKU1 à Hong Kong au début de 2005.
SRAS-CoV : 2003 en Chine (source animale encore inconnue, les chauves-souris l'auraient donné à d'autres animaux, probablement des civettes)
MER : 2012 en Arabie Saoudite (transmis par des dromadaires)
SRAS-CoV-2: 2019 à Wuhan (source pas encore connue, peut-être des chauves-souris)
Quels sont les symptômes qu'ils provoquent ?
Avant le SARS-CoV-2 et le MERS, le SARS-CoV était le premier exemple de coronavirus humain qui pourrait provoquer une maladie grave chez l'homme sous la forme d'un syndrome respiratoire aigu sévère. D'autres coronavirus humains tels que OC43 et 229E sont connus pour provoquer le rhume, tandis que NL63 est associé à des symptômes respiratoires graves tels qu'une infection des voies respiratoires supérieures et une pneumonie.
Selon un article publié dans Microbiology and Molecular Biology Reviews en 2005, alors que NL63 est principalement associé à des infections chez les enfants, il a également été détecté chez des adultes immunodéprimés atteints d'infections des voies respiratoires. OC43 peut également provoquer une gastro-entérite.
Le SRAS-CoV, quant à lui, a été identifié après les épidémies de 2003 en Chine. On pense qu'il provient d'une source animale encore inconnue, probablement des chauves-souris. Les symptômes du SRAS comprennent la toux, l'essoufflement, la diarrhée. Dans les cas graves, les symptômes peuvent évoluer vers une détresse respiratoire, ce qui peut nécessiter des soins intensifs.
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Le MERS est une autre maladie respiratoire virale causée par un coronavirus humain, qui a été identifié pour la première fois en Arabie saoudite en 2012. Les symptômes typiques comprennent la fièvre, la toux et l'essoufflement.
De plus, alors que le SARS-CoV-2 est considéré comme plus doux que le SARS-CoV et le MERS, il est particulièrement difficile de contrôler son épidémie, compte tenu de sa forte contagiosité.
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