Expliqué : Qu'est-ce que la « valeur CT » dans un test Covid-19 et pourquoi est-ce important ?

La valeur seuil du cycle émerge dans les tests RT-PCR pour le coronavirus, et détermine si une personne est positive pour Covid-19 ou non. Dans quelle mesure est-il corrélé avec la charge virale et la gravité de la maladie ?

Un test RT-PCR détecte le virus ; La valeur Ct définit une référence pour savoir si une personne doit être considérée comme positive. (Photo expresse : Amit Mehra)

Parmi les divers termes scientifiques que la pandémie de Covid-19 a fait partie du vocabulaire public, l'un est la « valeur Ct » dans les tests RT-PCR pour déterminer si un patient est positif pour Covid-19.

C'était l'objet d'une récente demande adressée par le gouvernement du Maharashtra au Conseil indien de la recherche médicale (ICMR). L'État a cherché à savoir s'il était conseillé de traiter une personne comme Covid-négative si la valeur Ct est supérieure à 24 et que la personne est asymptomatique. Les responsables de l'État ont déclaré que divers documents de l'ICMR avaient mentionné différentes valeurs de Ct et qu'il y avait des points de vue divergents même entre Niti Aayog et le National Center for Disease Control.

Quelques jours plus tard, le DG de l'ICMR a répondu au secrétaire d'État à la Santé que l'ICMR a pris les données des laboratoires de virologie à travers le pays pour arriver à une valeur seuil unique de Ct. Tous les patients avec une valeur Ct inférieure à 35 peuvent être considérés comme positifs tandis que ceux avec une valeur Ct supérieure à 35 peuvent être considérés comme négatifs, a déclaré l'ICMR.

Mais qu'est-ce que la valeur Ct ?

Abréviation de seuil de cycle, Ct est une valeur qui émerge lors des tests RT-PCR, l'étalon-or pour la détection du coronavirus SARS-CoV-2. Dans un test RT-PCR, l'ARN est extrait de l'écouvillon prélevé sur le patient. Il est ensuite converti en ADN, qui est ensuite amplifié. L'amplification fait référence au processus de création de plusieurs copies du matériel génétique - dans ce cas, l'ADN. Cela améliore la capacité du test à détecter la présence de virus. L'amplification se déroule à travers une série de cycles - une copie devient deux, deux devient quatre, et ainsi de suite - et c'est après plusieurs cycles qu'une quantité détectable de virus est produite.

Selon l'avis ICMR, la valeur Ct d'une réaction RT-PCR est le nombre de cycles auxquels la fluorescence du produit PCR est détectable au-delà du signal de fond. En termes simples, la valeur Ct fait référence au nombre de cycles après lesquels le virus peut être détecté. Si un nombre plus élevé de cycles est requis, cela implique que le virus n'a pas été détecté lorsque le nombre de cycles était inférieur. Plus la valeur Ct est basse, plus la charge virale est élevée, car le virus a été repéré après moins de cycles.

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Pourquoi la valeur CT est-elle importante ?

Pour mettre cela en contexte, regardons l'avis de l'ICMR et la lettre du Maharashtra à l'ICMR. Selon l'ICMR, un patient est considéré comme positif au Covid si la valeur Ct est inférieure à 35. En d'autres termes, si le virus est détectable après 35 cycles ou plus tôt, alors le patient est considéré comme positif. Si la référence devait être abaissée à 24 – la valeur mentionnée dans la lettre du Maharashtra – cela signifierait que les valeurs Ct comprises entre 25 et 34 ne seraient pas considérées comme positives. Une référence de 35, par conséquent, signifie que plus de patients seraient considérés comme positifs que nous n'en obtiendrions si la référence était de 24. L'ICMR a déclaré que l'abaissement du paramètre de seuil Ct peut entraîner la disparition de plusieurs personnes infectieuses.

On peut considérer la valeur Ct comme une mesure du potentiel de transmission, a déclaré le principal virologue Dr Shahid Jameel. Donc, s'il y a plus de virus dans ma gorge et mon nez, je le transmettrai mieux, a déclaré le Dr Jameel, directeur de la Trivedi School of Biosciences de l'Université Ashoka.

Quelle est la signification du seuil ICMR de 35 ?

À l'échelle mondiale, la valeur seuil acceptée pour la valeur Ct pour Covid-19 varie entre 35 et 40, selon les instructions des fabricants respectifs d'équipements de test. L'ICMR est arrivé à la valeur Ct de 35 sur la base des expériences de laboratoire et des apports de plusieurs laboratoires de virologie.

Il n'y a pas eu de nouvel avis, mais l'ICMR a informé le gouvernement du Maharashtra qu'il n'était pas conseillé d'utiliser un paramètre de seuil de cycle inférieur car cela entraînerait la disparition de plusieurs personnes infectieuses et augmenterait la transmission de la maladie, a déclaré le Dr Balram Bhargava, DG de l'ICMR.

Existe-t-il une corrélation entre une valeur Ct et la gravité de la maladie ?

Non. Bien que la valeur Ct soit inversement corrélée à la charge virale, elle n'a aucune incidence sur la gravité de la maladie, selon les experts. Une patiente peut avoir une valeur Ct faible, ce qui signifie que sa charge virale est suffisamment élevée pour être détectée rapidement, mais elle peut toujours être asymptomatique.

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Une petite étude publiée dans l'Indian Journal of Medical Microbiology en janvier de cette année a révélé qu'il n'y avait aucune corrélation entre les valeurs de Ct et la gravité de la maladie ou la mortalité chez les patients atteints de la maladie de Covid-19. Il a constaté que le temps écoulé depuis l'apparition des symptômes a une relation plus forte avec les valeurs de Ct par rapport à la gravité de la maladie.

La valeur Ct nous renseigne sur la charge virale dans la gorge et non dans les poumons, a déclaré le Dr Parikshit Prayag, consultant pour les maladies infectieuses à l'hôpital Deenanath Mangeshkar de Pune. La valeur Ct n'est pas corrélée avec la gravité - seulement avec l'infectiosité. Dans le premier rapport, je ne regarde pas vraiment la valeur Ct, mais pour le suivi des patients à l'hôpital, je considère la valeur Ct, car je peux alors décider de transférer ou non le patient dans le bâtiment non-Covid . Du point de vue de l'infectiosité, cela peut avoir de l'importance, pas la gravité, a déclaré le Dr Prayag.

Une valeur Ct élevée signifie-t-elle toujours une faible charge virale ?

Bien que cela puisse être l'inférence évidente, certains experts soulignent que certains patients peuvent avoir une valeur Ct élevée et pourtant avoir un niveau très important d'infection à Covid-19, et vice versa. De nombreux facteurs sont importants dans l'interprétation d'un test RT-PCR, et les résultats peuvent également dépendre de la méthode de prélèvement des échantillons et du temps écoulé entre l'infection et le prélèvement et l'analyse.

Un avis de l'ICMR en août de l'année dernière a noté que les valeurs de Ct dépendent de la façon dont l'échantillon a été collecté. Un échantillon mal collecté peut refléter des valeurs Ct inappropriées. En outre, les valeurs Ct sont également déterminées par la compétence technique de la personne effectuant le test, l'étalonnage de l'équipement et les compétences analytiques des interprètes.

Encore une fois, les valeurs de Ct peuvent différer entre les échantillons nasaux et oropharyngés prélevés sur le même individu. La température de transport, ainsi que le temps pris entre la collecte et la réception en laboratoire, peuvent également avoir un impact négatif sur les valeurs de Ct.

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