Nouvelle recherche : identifier des cibles potentielles pour des médicaments qui pourraient agir contre tous les coronavirus
Les médicaments se lient souvent à l'intérieur des poches sur les protéines qui maintiennent le médicament confortablement, l'amenant à interférer avec la fonction de la protéine. Les scientifiques peuvent identifier des poches potentielles de liaison aux médicaments à partir des structures 3D des protéines virales.
Ils ont rapporté leurs découvertes dans le Journal of Proteome Research de l'American Chemical Society. L'émergence possible de variantes du SRAS-CoV-2 résistantes aux vaccins, ainsi que de nouveaux coronavirus, rend important la recherche de traitements qui fonctionnent contre tous les coronavirus.
Maintenant, les chercheurs ont analysé les protéines virales de 27 espèces de coronavirus et des milliers d'échantillons de patients Covid-19, identifiant des séquences hautement conservées qui pourraient constituer les meilleures cibles médicamenteuses. Ils ont rapporté leurs découvertes dans le Journal of Proteome Research de l'American Chemical Society.
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Les médicaments se lient souvent à l'intérieur des poches sur les protéines qui maintiennent le médicament confortablement, l'amenant à interférer avec la fonction de la protéine. Les scientifiques peuvent identifier des poches potentielles de liaison aux médicaments à partir des structures 3D des protéines virales. Au fil du temps, cependant, les virus peuvent muter leurs poches de protéines de sorte que les médicaments ne conviennent plus.
Mais certaines poches de liaison aux médicaments sont si essentielles à la fonction de la protéine qu'elles ne peuvent pas être mutées, et ces séquences sont généralement conservées dans le temps dans le même virus et dans les virus apparentés.
Dans l'étude, le chercheur Matthieu Schapira et ses collègues voulaient trouver les poches de liaison aux médicaments les plus conservées dans les protéines virales à partir d'échantillons de patients Covid-19 et d'autres coronavirus, révélant les cibles les plus prometteuses pour les médicaments contre le pan-coronavirus, a déclaré l'American Chemical Society dans un communiqué de presse sur la recherche.
L'équipe a utilisé un algorithme informatique pour identifier les poches de liaison aux médicaments dans les structures 3D de 15 protéines SARS-CoV-2. Les chercheurs ont ensuite trouvé des protéines correspondantes dans 27 espèces de coronavirus et comparé leurs séquences dans les poches de liaison aux médicaments.
Les deux sites médicamenteux les plus conservés impliquaient des protéines (appelées respectivement nsp13 et nsp12) qui sont impliquées dans la réplication et la transcription de l'ARN viral.
Les chercheurs ont déclaré que de nouveaux médicaments antiviraux ciblant le site catalytique de la protéine nsp12 sont actuellement en essais cliniques de phase II et III pour Covid-19, et que le site de liaison à l'ARN de nsp13 est une cible auparavant sous-explorée qui devrait être une priorité élevée pour le développement de médicaments. .
Source : Société chimique américaine
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